Quarzit in Pulverform kann aufgrund seines Gehalts an Kristallines Siliziumdioxid giftig sein.
Da Quarzit eine Form von Kieselsäure ist, kann dies an verschiedenen Arbeitsplätzen Anlass zur Sorge geben. Durch Schneiden, Schleifen, Zerkleinern, Schleifen, Bohren und Polieren von Natur- und Steinprodukten können gefährliche Mengen sehr kleiner, kristalliner Quarzstaubpartikel in die Luft gelangen, die die Arbeiter atmen. Kristalline Kieselsäure von alveolengängiger Größe ist ein anerkanntes menschliches Karzinogen und kann zu anderen Erkrankungen der Lunge wie Silikose und Lungenfibrose führen.
Quarz, Silica, kristallines Silica und Feuerstein sind ungiftige Materialien. Der sehr feine quarzhaltige Staub (auch bekannt als lungengängiges kristallines Silizium, RCS) kann allerdings schwere und tödliche Lungenerkrankungen verursachen. Lapidare sollten beim Schneiden von Silica äußerst vorsichtig sein.