Xenotim kommt als geringfügiges Nebenmineral vor und kommt in Pegmatiten und anderen magmatischen Gesteinen sowie in Gneisen vor, die reich an Glimmer und Quarz sind. Assoziierte Mineralien umfassen Biotit und andere Glimmer, Mineralien der Chloritgruppe, Quarz, Zirkon, bestimmte Feldspate, Analcim, Anatas, Brookit, Rutil, Siderit und Apatit. Xenotim ist auch als diagenetisch bekannt: Es kann sich als winzige Körner oder als extrem dünne (weniger als 10 µ) Beschichtungen auf detritalen Zirkonkörnern in silikiklastischen Sedimentgesteinen bilden. Die Bedeutung dieser diagenetischen Xenotimablagerungen für die radiometrische Datierung von Sedimentgesteinen wird erst allmählich erkannt. Die 1824 entdeckte Xenotime-Typuslokalität ist Hidra (Hitterø), Flekkefjord, Vest-Agder, Norwegen. Andere bemerkenswerte Orte sind: Arendal und Tvedestrand, Norwegen; Novo Horizonte, São Paulo, Novo Horizonte, Bahia und Minas Gerais, Brasilien; Madagaskar und Kalifornien, Colorado, Georgia, North Carolina und New Hampshire, USA. Eine neue Entdeckung von gemmy, Farbwechsel (bräunlich bis gelb) Xenotim wurde aus Afghanistan gemeldet und in Pakistan gefunden. Nördlich des Mount Funabuse in der japanischen Präfektur Gifu wird auf einem Hügel namens Maru-Yama ein bemerkenswertes Basaltgestein abgebaut: Xenotim- und Zirkonkristalle, die in einem strahlenden, blütenartigen Muster angeordnet sind, sind in polierten Felsscheiben sichtbar, die bekannt sind als Chrysanthemenstein (übersetzt aus dem Japanischen 菊 石 kiku-ishi). Dieser Stein wird in Japan wegen seines Zierwerts weithin geschätzt. Kleine Mengen Xenotimsand werden im Zusammenhang mit dem malaysischen Zinnabbau usw. gewonnen und kommerziell verarbeitet. Der Lanthanoidgehalt ist typisch für "Yttrium-Erde" -Mineralien und beträgt etwa zwei Drittel Yttrium, wobei der Rest hauptsächlich aus schweren Lanthaniden besteht, bei denen die geradzahligen Lanthaniden (wie Gd, Dy, Er oder Yb) jeweils vorhanden sind etwa das 5% -Niveau und die ungeradzahligen Lanthaniden (wie Tb, Ho, Tm, Lu) liegen jeweils bei etwa 1% vor. Dysprosium ist normalerweise das am häufigsten vorkommende der geradzahligen Schwergewichte, und Holmium ist das am häufigsten vorkommende der ungeradzahligen Schwergewichte. Die leichtesten Lanthaniden sind in Monazit im Allgemeinen besser vertreten, während die schwersten Lanthaniden in Xenotim enthalten sind.