Magnetite kommt manchmal in großen Mengen im Strandsand vor. Solche schwarzen Sande (Mineralsande oder Eisensande) kommen an verschiedenen Orten vor, beispielsweise in Lung Kwu Tan in Hongkong; Kalifornien, Vereinigte Staaten; und die Westküste der Nordinsel Neuseelands. Der von Felsen erodierte Magnetit wird von Flüssen zum Strand getragen und durch Wellenbewegungen und Strömungen konzentriert. In gebänderten Eisenformationen wurden riesige Ablagerungen gefunden. Diese Sedimentgesteine wurden verwendet, um auf Änderungen des Sauerstoffgehalts der Erdatmosphäre zu schließen. Große Ablagerungen von Magnetit finden sich auch in der Atacama-Region in Chile; die Valentines Region von Uruguay; Kiruna, Schweden; die Regionen Pilbara, Midwest und Northern Goldfields in Westaustralien; die Eyre-Halbinsel in Südaustralien; die Region Tallawang in New South Wales; und in der Adirondack-Region von New York in den Vereinigten Staaten. Kediet ej Jill, der höchste Berg Mauretaniens, besteht ausschließlich aus Mineralien. Einlagen finden sich auch in Norwegen, Deutschland, Italien, der Schweiz, Südafrika, Indien, Indonesien, Mexiko, Hongkong und in Oregon, New Jersey, Pennsylvania, North Carolina, West Virginia, Virginia, New Mexico, Utah und Colorado Die Vereinigten Staaten. Im Jahr 2005 entdeckte ein Explorationsunternehmen, Cardero Resources, in Peru eine riesige Lagerstätte magnetithaltiger Sanddünen. Das Dünenfeld erstreckt sich über 250 Quadratkilometer, wobei sich die höchste Düne über 2.000 Meter über dem Wüstenboden befindet. Der Sand enthält 10% Magnetit. In ausreichend großen Mengen kann Magnetit die Kompassnavigation beeinflussen. In Tasmanien gibt es viele Gebiete mit stark magnetisierten Gesteinen, die den Kompass stark beeinflussen können. Bei Verwendung eines Kompasses in Tasmanien sind zusätzliche Schritte und wiederholte Beobachtungen erforderlich, um Navigationsprobleme auf ein Minimum zu beschränken. Magnetitkristalle mit kubischem Habitus wurden nur an einem Ort gefunden: Balmat, St. Lawrence County, New York. Magnetit kommt aufgrund der Biomineralisierung auch in Fossilien vor und wird als Magnetofossilien bezeichnet. Es gibt auch Fälle von Magnetit, dessen Ursprung im Weltraum von Meteoriten stammt.