Presente come minerale accessorio minore, lo xenotima si trova nelle pegmatiti e in altre rocce ignee, così come negli gneiss ricchi di mica e quarzo. I minerali associati includono biotite e altre miche, minerali del gruppo clorite, quarzo, zircone, alcuni feldspati, analcime, anatasio, brookite, rutilo, siderite e apatite. La xenotima è anche nota per essere diagenetica: può formarsi come grani minuti o come rivestimenti estremamente sottili (meno di 10 µ) sui granuli di zirconi detritici nelle rocce sedimentarie silicoclastiche. L'importanza di questi depositi xenotimici diagenetici nella datazione radiometrica delle rocce sedimentarie sta solo cominciando a rendersi conto. Scoperta nel 1824, la località tipo di xenotime è Hidra (Hitterø), Flekkefjord, Vest-Agder, Norvegia. Altre località degne di nota includono: Arendal e Tvedestrand, Norvegia; Novo Horizonte, San Paolo, Novo Horizonte, Bahia e Minas Gerais, Brasile; Madagascar e California, Colorado, Georgia, North Carolina e New Hampshire, Stati Uniti. Una nuova scoperta della gemmia, il cambiamento di colore (dal marrone al giallo) xenotima è stata segnalata dall'Afghanistan ed è stata trovata in Pakistan. A nord del monte Funabuse nella prefettura di Gifu, in Giappone, una notevole roccia basaltica viene estratta su una collina chiamata Maru-Yama: cristalli di xenotime e zirconi disposti in un motivo a forma di fiore radiante sono visibili in fette levigate della roccia, che è noto come pietra crisantemo (tradotto dal giapponese 菊 石 kiku-ishi). Questa pietra è molto apprezzata in Giappone per il suo valore ornamentale. Piccole tonnellate di sabbia xenotime vengono recuperate in associazione con l'estrazione di stagno malese, ecc. E vengono lavorate commercialmente. Il contenuto di lantanidi è tipico dei minerali di "ittrio terrestre" e contiene circa due terzi di ittrio, con il resto costituito principalmente dai lantanidi pesanti, dove i lantanidi di numero pari (come Gd, Dy, Er o Yb) sono presenti ciascuno a circa il livello del 5% e i lantanidi di numero dispari (come Tb, Ho, Tm, Lu) ciascuno essendo presenti a circa il livello dell'1%. Il disprosio è solitamente il più abbondante dei pesi massimi pari, e l'olmio è il più abbondante dei pesi massimi dispari. I lantanidi più leggeri sono generalmente meglio rappresentati in monazite mentre i lantanidi più pesanti sono in xenotime.