L'inalazione di silice cristallina è dannosa per i polmoni, causando silicosi. Si ritiene che la silice amorfa abbia una bassa tossicità, ma l'inalazione prolungata provoca alterazioni ai polmoni. La farina fossile è per lo più silice amorfa, ma contiene un po 'di silice cristallina, specialmente nelle forme di acqua salata. In uno studio sui lavoratori, quelli esposti a DE naturale per oltre 5 anni non hanno avuto alterazioni polmonari significative, mentre il 40% di quelli esposti alla forma calcinata aveva sviluppato pneumoconiosi. Le formulazioni di DE comune di oggi sono più sicure da usare in quanto sono costituite prevalentemente da silice amorfa e contengono poca o nessuna silice cristallina. Il contenuto di silice cristallina di DE è regolato negli Stati Uniti dall'Occupational Safety and Health Administration (OSHA) e ci sono linee guida dell'Istituto nazionale per la sicurezza e la salute sul lavoro che stabiliscono quantità massime consentite nel prodotto (1%) e nel aria in prossimità della zona di respirazione dei lavoratori, con un limite di esposizione consigliato di 6 mg / m nell'arco di una giornata lavorativa di 8 ore. L'OSHA ha fissato un limite di esposizione consentito per la farina fossile a 20 mppcf (80 mg / m /% SiO2). A livelli di 3000 mg / m, la farina fossile è immediatamente pericolosa per la vita e la salute. Negli anni '30, si scoprì che l'esposizione professionale a lungo termine tra i lavoratori dell'industria della cristobalite DE che erano stati esposti ad alti livelli di silice cristallina dispersa nell'aria per decenni presentava un aumentato rischio di silicosi. Oggi, i lavoratori sono tenuti a utilizzare misure di protezione delle vie respiratorie quando le concentrazioni di silice superano i livelli consentiti. La diatomite prodotta per i filtri delle piscine viene trattata con calore elevato (calcinazione) e un agente fondente (carbonato di sodio), facendo assumere al biossido di silicio amorfo un tempo innocuo la sua forma cristallina.
