Quartzito em forma de pó pode ser tóxico devido ao seu conteúdo de Sílica Cristalina.
Como o quartzito é uma forma de sílica, é um possível motivo de preocupação em vários locais de trabalho. Cortar, esmerilhar, lascar, lixar, furar e polir produtos de pedra naturais e manufaturados podem liberar níveis perigosos de partículas de pó de sílica cristalinas muito pequenas no ar que os trabalhadores respiram. A sílica cristalina de tamanho respirável é um cancerígeno humano reconhecido e pode levar a outras doenças pulmonares, como silicose e fibrose pulmonar.
Quartzo, sílica, sílica cristalina e sílex são materiais não tóxicos, mas a poeira muito fina contendo quartzo, conhecida como silício cristalino respirável (RCS), pode causar doenças pulmonares graves e fatais. Os lapidários devem ter cautela ao cortar a sílica.