Volgens hun ontstaan vallen de scapolietrotsen van nature in vier groepen.
Kalksteen en contact met metamorfe gesteenten
De scapoliet kalksteen en contact met metamorfe gesteenten. Als calciumrijke silicaten is het te verwachten dat deze mineralen worden aangetroffen waar onzuivere kalksteen is gekristalliseerd door contact met een stollingsmagma. Zelfs marialiet (de variëteit die het rijkst is aan soda) komt voor in deze associatie, en wordt voornamelijk verkregen in kleine kristallen die holtes bekleden in uitgeworpen blokken kristallijn kalksteen bij de Vesuvius en de kraters van de Eifel in Duitsland. Scapoliet en werneriet komen veel vaker voor bij de contacten van kalksteen met opdringerige massa's. De mineralen die ze vergezellen zijn calciet, epidoot, vesuvianiet, granaat, wollastoniet, diopside en amfibool. De scapolieten zijn kleurloos, vleeskleurig, grijs of groenachtig; soms zijn ze bijna zwart door de aanwezigheid van zeer kleine omhullingen van grafietmateriaal. Ze zijn niet in erg perfecte kristallen, hoewel soms onvolledige achthoekige secties zichtbaar zijn; de tetragonale splitsing, sterke dubbele breking en uniaxiale interferentiefiguur onderscheiden ze gemakkelijk van andere mineralen. Gewoonlijk verweren ze tot ijzige aggregaten, maar soms wordt ze door een isotrope substantie van onbekende aard vervangen. In kristallijne kalksteen en kalksilicaatgesteenten komen ze voor in kleine en meestal onopvallende korrels vermengd met de andere componenten van het gesteente. Grote, bijna idiomorfe kristallen worden soms gevonden in kleiachtige gesteenten (veranderde kalkhoudende leisteen) die een thermische metamorfose hebben ondergaan. In de Pyreneeën zijn er uitgestrekte ontsluitingen van kalksteen die door stollingsgesteenten worden gepenetreerd, beschreven als ophieten (variëteiten van diabaas) en lherzolieten (peridotieten). Bij de contacten komt scapoliet op een groot aantal plaatsen voor, zowel in de kalksteen als in de daarbij behorende kalkhoudende schalie. In sommige van deze gesteenten komen grote kristallen van een van de scapolietmineralen (een centimeter of twee lang) voor, meestal als achthoekige prisma's met onvolmaakte uiteinden. In andere wordt het mineraal aangetroffen in kleine onregelmatige korrels. Het is soms helder, maar vaak vol met minuscule omhullingen van augiet, toermalijn, biotiet en andere mineralen, zoals de omringende matrix. Uit deze districten is ook een zwarte variëteit bekend, gevuld met minuscule grafietachtige omhulsels, vaak buitengewoon klein en waardoor het mineraal bijna ondoorzichtig is. De namen couzeraniet en dipyre worden vaak aan dit soort scapoliet gegeven. Blijkbaar bepaalt de aanwezigheid van chloor in kleine hoeveelheden, die vaak in kalksteen worden aangetroffen, tot op zekere hoogte de vorming van het mineraal.
Mafische stollingsgesteenten
In veel mafische stollingsgesteenten, zoals gabbro en diabaas, vervangt scapoliet veldspaat door een secundair of metasomatisch proces. Enkele microscopisch onderzochte Noorse scapoliet-gabbros (of dioriet) leveren voorbeelden op van elke fase van het proces. De betrokken chemische veranderingen zijn erg klein, een van de belangrijkste is de aanname van een kleine hoeveelheid chloor in het nieuwe molecuul. Vaak wordt gezien dat het scapoliet zich door de veldspaat verspreidt, waarbij delen volledig worden vervangen, terwijl andere nog vers en ongewijzigd zijn. De veldspaat verweert niet, maar blijft fris, en de transformatie lijkt eerder op metamorfose dan op verwering. Het is geen oppervlakkig proces, maar vindt blijkbaar op enige diepte plaats onder druk, en waarschijnlijk door de werking van oplossingen of dampen die chloriden bevatten. De basis veldspaat van natronkalk (labradoriet tot anorthiet) zijn degenen die dit soort veranderingen ondergaan. Veel gevallen van scapolitisering zijn beschreven vanuit de ofieten (diabasen) van de Pyreneeën. In ongewijzigde toestand zijn deze ofitisch en bestaan uit pyroxeen die latvormige plagioklaasveldspaat omsluit; het pyroxeen wordt vaak veranderd in uraliet. Wanneer de veldspaat wordt vervangen door scapoliet, is het nieuwe mineraal fris en helder en bevat het vaak kleine korrels hoornblende. Uitgebreide herkristallisatie vindt vaak plaats en het uiteindelijke product is een gevlekte rots met witte ronde stukjes scapoliet omgeven door korrelige aggregaten van heldergroene hoornblende: in feite verdwijnt de oorspronkelijke structuur.
Scapoliet-hoornblende rotsen
In Noorwegen zijn scapoliet-hoornblende-rotsen al lang bekend bij Ødegården en andere plaatsen. Ze worden gevlekte gabbros genoemd, maar bevatten meestal geen veldspaat, de witte vlekken zijn volledig scapoliet, terwijl de donkere matrix die ze omhult een aggregaat is van groen of bruin hoornblende. Ze lijken in veel opzichten sterk op de gescapolitiseerde ophieten van de Pyreneeën. Er is gesuggereerd dat de omzetting van hun oorspronkelijke veldspaat (want het lijdt geen twijfel dat het ooit gabbros waren, bestaande uit plagioklaas en pyroxeen) in scapoliet, het gevolg is van de percolatie van chlorideoplossingen langs lijnen van zwakte, of vlakken van oplosbaarheid, het vullen van holtes die in de substantie van het mineraal zijn geëtst. Vervolgens werden de chloriden geabsorbeerd en werd de veldspaat omgezet in scapoliet. Maar het blijkt dat er in deze gabbros aderen zijn van een chloorhoudend apatiet, dat moet zijn afgezet door gassen of vloeistoffen die van onderaf opstijgen. Dit suggereert dat er een pneumatolytisch proces aan het werk is, vergelijkbaar met dat waarbij rond indringers van graniet aderen zijn gevormd die rijk zijn aan toermalijn, en de omringende rotsen tegelijkertijd doordrongen zijn van dat mineraal. In de samenstelling van de actieve gassen is een opvallend verschil te zien, want de gassen die uit het graniet komen, zijn voornamelijk fluor en boor, terwijl die uit de gabbro voornamelijk chloor en fosfor zijn. In één geval wordt de veldspaat vervangen door kwarts en witte mica (in greisen) of kwarts en toermalijn (in schorlrotsen); in het andere geval is scapoliet het belangrijkste nieuwe product. De analogie is heel dichtbij, en deze theorie krijgt veel steun van het feit dat er in Canada (op verschillende plaatsen in Ottawa en Ontario) talrijke waardevolle apatietafzettingen zijn. Ze liggen in basisgesteenten zoals gabbro en pyroxeniet, en deze in de buurt van de aderen zijn uitgebreid gescapolitiseerd, zoals de gevlekte gabbros van Noorwegen.
Metamorfe gesteenten met een gneissose-karakter
In veel delen van de wereld komen metamorfe gesteenten met gneissosekarakter voor die scapoliet als essentieel bestanddeel bevatten. Hun oorsprong is vaak onduidelijk, maar het is waarschijnlijk dat ze van twee soorten zijn. De ene serie is in wezen stollingsmiddel (orthogneisses); meestal bevatten ze bleekgroene pyroxeen, een variabele hoeveelheid veldspaat, sfeen en ijzeroxiden. Kwarts, rutiel, groene hoornblende en biotiet zijn vaak aanwezig, terwijl granaat soms voorkomt; hyperstheen is zeldzaam. Ze komen voor samen met andere soorten pyroxeen-gneis, hoornblende gneis, amfibolieten, enz. Bij veel van hen is er geen reden om eraan te twijfelen dat het scapoliet een primair mineraal is. Andere scapoliet-gneissen die even metamorf zijn qua aspect en structuur, lijken afzettingsgesteenten te zijn. Velen van hen bevatten calciet of zijn zeer rijk aan calc-silicaten (wollastoniet, diopsied, enz.), Wat suggereert dat het oorspronkelijk onzuivere kalkstenen waren. De veelvuldige associatie van dit type met grafiet-leisteen en andalusiet-leisteen maakt deze correlatie in alle opzichten waarschijnlijk. Biotiet is een veel voorkomend mineraal in deze gesteenten, die vaak ook veel kwarts en alkalische veldspaat bevatten.