Inademing van kristallijn silica is schadelijk voor de longen en veroorzaakt silicose. Van amorf silica wordt aangenomen dat het een lage toxiciteit heeft, maar langdurige inademing veroorzaakt veranderingen in de longen. Diatomeeënaarde is meestal amorf silica, maar bevat wat kristallijn silica, vooral in de zoutwatervormen. In een onderzoek onder werknemers hadden degenen die meer dan 5 jaar aan natuurlijke DE waren blootgesteld geen significante longveranderingen, terwijl 40% van degenen die aan de gecalcineerde vorm waren blootgesteld pneumoconiose had ontwikkeld. amorf silica en bevatten weinig of geen kristallijn silica. Het gehalte aan kristallijn silica van DE wordt in de Verenigde Staten gereguleerd door de Occupational Safety and Health Administration (OSHA), en er zijn richtlijnen van het National Institute for Occupational Safety and Health waarin de maximale hoeveelheden zijn toegestaan in het product (1%) en in de lucht nabij de ademhalingszone van werknemers, met een aanbevolen blootstellingslimiet van 6 mg / m2 gedurende een werkdag van 8 uur. OSHA heeft een toegestane blootstellingslimiet voor diatomeeënaarde vastgesteld op 20 mppcf (80 mg / m /% SiO2). Bij niveaus van 3000 mg / m is diatomeeënaarde onmiddellijk gevaarlijk voor leven en gezondheid. In de jaren dertig bleek langdurige beroepsmatige blootstelling van werknemers in de cristobaliet DE-industrie die gedurende decennia aan hoge niveaus van kristallijn silica in de lucht waren blootgesteld, een verhoogd risico op silicose te hebben. Tegenwoordig moeten werknemers ademhalingsbeschermingsmaatregelen nemen wanneer de concentraties silica de toegestane niveaus overschrijden. Diatomiet geproduceerd voor zwembadfilters wordt behandeld met hoge hitte (calcinering) en een vloeimiddel (natriumcarbonaat), waardoor het voorheen onschadelijke amorfe siliciumdioxide zijn kristallijne vorm aanneemt.