على الرغم من أن السيلينيوم عنصر أساسي ، إلا أنه سام إذا تم تناوله بكميات زائدة. يمكن أن يؤدي تجاوز مستوى المدخول الأعلى المسموح به وهو 400 ميكروغرام في اليوم إلى الإصابة بالشيخوخة. يعتمد مستوى المدخول الأعلى المسموح به البالغ 400 ميكروغرام بشكل أساسي على دراسة أجريت عام 1986 على خمسة مرضى صينيين أظهروا علامات صريحة على الإصابة بالشيخوخة ودراسة متابعة على نفس الأشخاص الخمسة في عام 1992. وجدت دراسة عام 1992 في الواقع الحد الأقصى من المدخول الغذائي الآمن للسيليكون. ما يقرب من 800 ميكروغرام في اليوم (15 ميكروغرام لكل كيلوغرام من وزن الجسم) ، ولكن اقترح 400 ميكروغرام في اليوم لتجنب خلق اختلال في العناصر الغذائية في النظام الغذائي والتوافق مع البيانات من البلدان الأخرى. في الصين ، عانى الأشخاص الذين تناولوا الذرة المزروعة في الفحم الحجري الغني بالسيلينيوم (الصخر الكربوني) من سمية السيلينيوم. تبين أن هذا الفحم يحتوي على نسبة عالية من السيلينيوم تصل إلى 9.1 ٪ ، وهو أعلى تركيز في الفحم تم تسجيله على الإطلاق. تشمل علامات وأعراض التهاب الكبد ظهور رائحة الثوم في التنفس ، واضطرابات الجهاز الهضمي ، وفقدان الشعر ، وتقشر الأظافر ، والتعب ، والتهيج ، والأضرار العصبية. يمكن أن تظهر الحالات الشديدة من التهاب الكبد على تليف الكبد أو الوذمة الرئوية أو الموت. يحتوي عنصر السيلينيوم ومعظم مركبات السلينيدات المعدنية على سمية منخفضة نسبيًا بسبب انخفاض التوافر البيولوجي. على النقيض من ذلك ، فإن السيلينات والسيلينيت لهما طريقة عمل مؤكسدة مماثلة لتلك الخاصة بثلاث أكسيد الزرنيخ وهي شديدة السمية. تتراوح الجرعة السامة المزمنة من السيلينيت للبشر من 2400 إلى 3000 ميكروغرام من السيلينيوم يوميًا. سيلينيد الهيدروجين هو غاز شديد السمية والتآكل. يوجد السيلينيوم أيضًا في المركبات العضوية ، مثل ثنائي ميثيل سيلينيد وسيلينوميثيونين وسيلينوسيستين وميثيل سيلينوسيستين ، وكلها ذات توافر بيولوجي عالٍ وهي سامة بجرعات كبيرة. في 19 أبريل 2009 ، توفي 21 مهور بولو قبل وقت قصير من المباراة في بطولة الولايات المتحدة المفتوحة للبولو. بعد ثلاثة أيام ، أصدرت صيدلية بيانًا يوضح أن الخيول قد تلقت جرعة غير صحيحة من أحد المكونات المستخدمة في مركب مكمل غذائي من الفيتامينات / المعادن والذي تم تحضيره بشكل غير صحيح بواسطة صيدلية مركبة. أشار تحليل مستويات الدم للمركبات غير العضوية في المكمل إلى أن تركيزات السيلينيوم كانت أعلى من 10 إلى 15 مرة من الطبيعي في عينات الدم ، و 15 إلى 20 مرة أعلى من المعتاد في عينات الكبد. تم تأكيد عنصر السيلينيوم في وقت لاحق ليكون العامل السام. قد ينتج التسمم بالسيلينيوم في أنظمة المياه عندما تكون دورات الجريان السطحي الزراعية الجديدة من خلال الأراضي الجافة غير المطورة بشكل طبيعي. ترشح هذه العملية مركبات السيلينيوم الطبيعية القابلة للذوبان (مثل السيلينات) في الماء ، والتي يمكن بعد ذلك أن تتركز في "الأراضي الرطبة" الجديدة مع تبخر الماء. يحدث تلوث الممرات المائية بالسيلينيوم أيضًا عندما يتم ترشيح السيلينيوم من رماد مداخن الفحم والتعدين وصهر المعادن ومعالجة النفط الخام ومدافن النفايات. تم العثور على مستويات عالية من السيلينيوم الناتجة في المجاري المائية لتسبب اضطرابات خلقية في أنواع البيض ، بما في ذلك الطيور والأسماك في الأراضي الرطبة. يمكن أن تؤدي المستويات الغذائية المرتفعة من ميثيل الزئبق إلى تضخيم الضرر الناجم عن سمية السيلينيوم في الأنواع البويضات. في الأسماك والحياة البرية الأخرى ، يعتبر السيلينيوم ضروريًا للحياة ، ولكنه سام في الجرعات العالية. بالنسبة للسلمون ، يكون التركيز الأمثل للسيلينيوم حوالي 1 ميكروجرام من السيلينيوم لكل جرام من وزن الجسم كله. أقل بكثير من هذا المستوى ، يموت صغار السلمون من النقص ؛ فوق ذلك بكثير ، يموتون من الفائض السام. حددت إدارة السلامة والصحة المهنية (OSHA) الحد القانوني (حد التعرض المسموح به) للسيلينيوم في مكان العمل عند 0.2 مجم / م خلال يوم عمل مدته 8 ساعات. حدد المعهد الوطني للسلامة والصحة المهنية (NIOSH) حدًا موصى به للتعرض (REL) يبلغ 0.2 مجم / م خلال يوم عمل مدته 8 ساعات. عند مستويات 1 مجم / م ، يكون السيلينيوم خطيرًا على الحياة والصحة على الفور.